Череповецкий уезд расположен в восточной части Новгородской губернии. Площадь Ч. уезда занимает 7303 кв. верст. Воды Череповецкого уезда принадлежат бассейну Волги: Шексна пересекает восточную часть уезда на протяжении 166 верст, она судоходна на всем протяжении (Мариинский водный путь), Молога отделяет уезд от Весьегонского уезда (Тверской губернии) на протяжении 64 верст: она судоходна (Тихвинский водный путь).